自然凈化系統

即通過自然方式過濾雨水，達到凈化雨水的目的。它主要有4種途徑：土壤涵養凈化、自然沉淀、植物凈化、滲透過濾。雨水的初期凈化主要依靠自然凈化，除簡單實用的滲透溢流井外，沒有專門的人工設施，方法簡單，投資少，效果非常突出。

自然凈化原理是：雨水首先盡可能地進入地表土壤涵養層涵養儲存。涵養飽和后多余的雨水經過地面徑流和洼地、湖塘等調節，然后通過管道排放。涵養水一部分補充地下水，一部分通過滲渠和大口井取水利用。實踐證明：該系統方法簡單易行，雨水利用量大，效果好，值得推廣應用。

人工過濾系統

即建設大量人工設施包括雨水蓄水池、雨水過濾裝置、雨水消毒設施來達到收集、凈化雨水的目的。在環境污染較嚴重的地區或對雨水質要求較高時可考慮采用人工過濾系統。